La ville de Charlotte se situe à environ 320 km à l’ouest de la ville d’Idaho Falls et à environ 70 km au sud-est de la ville d’Ontario.
Charlotte est la capitale de l’Etat de l’Idaho et a une superficie totale de 165,7 km².
Elle se trouve à 830 mètres d’altitude. Afin de différencier la ville du comté de Boise, peut être parfois appelée « Boise City ».